Une revue de la littérature et une enquête sur les études d’étiologie de la pneumonie infantile: –

Une revue de la littérature et une enquête sur les études d’étiologie de la pneumonie infantile: –

Le projet PERCH est la plus grande étude d’étiologie multipays de la pneumonie infantile depuis les études du Conseil sur la science et la technologie dans le développement international. Cependant, ce n’est pas la seule étude récente ou en cours sur l’étiologie de la pneumonie, et même sept Les fournisseurs de financement, les chercheurs et les décideurs comptent sur les meilleures données disponibles pour planifier stratégiquement les programmes, les nouvelles orientations de recherche et les interventions. Nous voulions décrire le paysage actuel des études récentes d’étiologie de la pneumonie chez les enfants de moins de 10 ans faits à propos des médicaments. Nous avons recueilli des informations sur la population étudiée, la conception de l’étude, les définitions de cas, les échantillons de laboratoire et les données de laboratoire. et méthodes et pathogènes identifiés Une revue de la littérature En juin, notre enquête auprès des chercheurs a permis d’identifier d’autres études d’étiologie de la pneumonie infantile en cours et récemment complétées. Ceci démontre le contexte général dans lequel l’étude PERCH doit être placée. Cependant, l’analyse du paysage révèle également une multiplicité d’études étiologiques. définitions des cas, niveaux de participation des cliniciens, types d’établissements, collecte d’échantillons et techniques de laboratoire. Il renforce la nécessité de standardiser les méthodes et les analyses pour les études actuelles et futures sur l’étiologie de la pneumonie afin d’optimiser leur potentiel cumulatif pour décrire avec précision les causes microbiennes de l’enfance. pneumonie

Chaque année, environ un million d’enfants meurent d’une pneumonie L’étude PERCH est la plus grande étude multisite de la pneumonie infantile depuis que les études BOSTID de la Commission des sciences et de la technologie pour le développement international PERCH doit identifier les étiologies attendues de la pneumonie, à un moment où la charge des principales causes de pneumonie bactérienne dans le monde en développement, Streptococcus pneumoniae et Haemophilus influenzae de type b Hib, sera probablement réduite par l’introduction généralisée et l’utilisation de vaccins conjugués De plus, PERCH capitalise sur de nouvelles techniques de diagnostic moléculaire qui n’étaient pas disponibles il y a plusieurs décennies lors des études BOSTID. Une autre différence importante entre PERCH et les études BOSTID est que les sites participant à PERCH suivront un protocole hautement standardisé incluant la standardisation des enrôlements. critères, collecte d’échantillons et laboratoire Bien que la PERCH soit la plus vaste étude multicentrique sur l’étiologie de la pneumonie infantile menée dans les pays en développement au cours des dernières décennies, elle n’est pas la seule étude contemporaine sur l’étiologie de la pneumonie et ne peut saisir toute la complexité de tous les contextes épidémiologiques. Ces études fourniront des données complémentaires utiles à l’étude PERCH qui permettra de mieux définir et caractériser les causes de la pneumonie infantile à travers le monde. Cependant, en raison des approches cliniques, de laboratoire et d’analyse statistique de ces maladies. Les différences dans l’étiologie observée peuvent provenir non seulement des différences épidémiologiques dans les sites et les populations étudiées, qui sont des attributs biologiques et épidémiologiques pertinents pour la prise de décision en matière de santé publique, mais aussi de variances épidémiologiques. Dans ce document, nous décrivons le paysage global des sites qui étudient actuellement l’étiologie de la pneumonie ou l’avons récemment étudié dans le contexte de PERCH. monde développé et en développement comme vérifié par une revue de la littérature des études avec des données depuis l’année et une enquête sur les chercheurs en pneumonie Nous ne visons pas à mener une revue systématique de la littérature ou une méta-analyse des résultats d’étude. évaluation critique des méthodes ou des résultats des études que nous avons identifiées Le but de ce projet se limite à une analyse du paysage pour mieux décrire l’étendue des données disponibles sur l’étiologie de la pneumonie infantile

Méthodes

Revue de littérature

Toutes les recherches ont été effectuées en juin en utilisant la base de données PubMed et en entrant des termes de recherche qui étaient des mots clés, des termes MeSH, des synonymes ou des troncatures. Huit stratégies de recherche distinctes ont été utilisées. ZG, YDK Informations extraites de la population étudiée, conception de l’étude, définitions de cas, échantillons de liquides corporels, méthodes de laboratoire et pathogènes identifiés Les études ont été regroupées par catégorie , et des statistiques sommaires ont été décrites en utilisant Stata version College Station, TX; Aucun test statistique n’a été effectué sur les données. Les critères d’inclusion pour les études étaient les suivants: Étude de la pneumonie aiguë communautaire ou de l’infection aiguë des voies respiratoires inférieures. Test de dépistage d’au moins une étiologie spécifique chez les patients enrôlés. Les critères d’exclusion étaient les suivants: Inscriptions exclusives des patients atteints de bronchioliteExclusion exclusive des patients présentant une complication spécifique ou des séquelles de pneumonie par exemple, l’empyème ou les épanchements parapneumoniques Incapacité à distinguer l’étiologie des cas de pneumonie d’autres syndromes, par exemple, les cas de pneumonie dans une étude de pneumococcie invasive.Etologie déduite de la seule voie aérienne supérieureFocus uniquement sur la résistance aux antibiotiques parmi les isolements pneumococciquesExclusion exclusive des patients hospitalisés pneumonieNotre objectif était Pour identifier les sites et les études, pas les publications Lorsque plus d’une publication a été identifiée dans la même étude, nous avons désigné la publication avec les résultats d’étiologie ou les détails de méthodologie les plus complets, la plus longue période de surveillance ou la plus ancienne référence. Lorsque les publications se référaient à un réseau de surveillance particulier incluant des sites dans plusieurs pays, nous avons inclus un résultat pour l’ensemble du réseau de surveillance et des résultats individuels pour chaque pays s’ils étaient publiés séparément. D’autres syndromes de maladie autres que la pneumonie, tels que la méningite et la septicémie, nous avons limité les résultats à des informations spécifiques à la pneumonie si possible. Les essais cliniques n’étaient inclus que s’ils décrivaient des méthodes pour les diagnostics étiologiques.

Enquête sur les chercheurs en pneumonie

Un sondage en ligne auprès de chercheurs ayant mené des recherches sur l’étiologie de la pneumonie a été créé pour recueillir des données sur des études d’étiologie de la pneumonie en cours ou récemment achevées chez des enfants de moins de cinq ans Survey Monkey, Palo Alto, Californie. aux membres de la communauté pneumonie qui appartenaient à la liste d’adresses électroniques de PneumoFOCUS , un bulletin mensuel sur les pneumonies, les pneumococcies et les pneumocoques, rédigé et produit par notre équipe de l’École de santé publique Johns Hopkins. qui avaient soumis des lettres d’intention en réponse à la demande de propositions de PERCH pour des sites, des chercheurs de sites sélectionnés pour faire partie de l’étude PERCH, d’autres chercheurs connus en surveillance de la pneumonie, par exemple les sites du Programme international des maladies infectieuses émergentes; les chercheurs identifiés par le bouche à oreille We i Nous avons suivi par courriel avec des chercheurs connus en pneumonie s’ils ne répondaient pas à notre demande initiale. L’enquête comprenait des questions sur la population étudiée, le plan d’étude, les définitions de cas, les échantillons de liquides corporels, les méthodes de laboratoire et pathogènes identifiés Des enquêtes distinctes ont été réalisées pour chaque étude si plus d’une étude a eu lieu dans un site géographique donné. Les études ont été regroupées par catégorie et des statistiques sommaires ont été décrites; aucun test statistique n’a été effectué sur les données

RÉSULTATS

Revue de littérature

Les titres et les résumés examinés ont été exclus parce qu’ils ne répondaient pas aux critères d’admissibilité. Le texte intégral des publications a été examiné et des études portant sur les résultats de l’étiologie de la pneumonie infantile ont été incluses Études de taille variée chez les patients atteints de pneumonie patients médians Nous avons identifié des études dans des pays supplémentaires Figure Plusieurs études ont été réalisées dans des pays Parmi ceux-ci, des études ont été identifiées aux États-Unis; dans chacun des pays suivants: Bangladesh et Inde; en Thaïlande; en Afrique du sud; dans chacun des pays suivants: Brésil, Philippines et Taïwan; en Chine, à Hong Kong, au Kenya, en Corée, au Japon, au Népal, au Nigéria et au Vietnam; En Argentine, en Éthiopie, en Finlande, au Guatemala, en Italie, au Mexique, au Mozambique, au Pakistan, au Yémen et en Zambie, trois études ont signalé la collecte de spécimens post-mortem dans les pays suivants: Brésil, Costa Rica, Salvador, États-Unis et Zambie. % dans les comtés Le Bangladesh, l’Équateur, la Gambie, l’Inde, le Malawi, le Mexique, le Nigéria, le Pakistan, l’Afrique du Sud et le Yémen ont déclaré avoir collecté des prélèvements pulmonaires [,,,,] sont résumés dans le tableau supplémentaire

Enquête

Nous avons reçu des réponses à l’enquête Un total d’études ont été identifiées après élimination des réponses qui ne répondaient pas aux critères de notre étude Parmi les études exclues de l’analyse, les raisons d’exclusion étaient les suivantes: l’étude n’était pas une étude d’étiologie Ne pas inclure les enfants de moins de cinq ans ou plusieurs réponses ont été reçues décrivant la même étude Études de taille allant de patients atteints de pneumonie patients médians Parmi les études d’étiologie de la pneumonie, les pays étaient représentés. étaient menées au Bangladesh; dans chacun des pays suivants: Brésil, Inde et Népal; en Indonésie; dans chacun des pays suivants: Kenya, Mozambique, Afrique du Sud, États-Unis, Australie, Thaïlande et Espagne; et dans chacun des pays suivants: Jordanie, Guatemala, Chine et Israël Deux études ont indiqué avoir obtenu l’autorisation de collecter des spécimens post-mortem dans leurs protocoles, mais aucun des deux sites n’avait collecté de spécimens post-mortem en mars.

DISCUSSION

à l’identification d’infections relativement plus virales Étant donné l’association entre sévérité clinique et étiologie, la population cible et le type d’établissement peuvent également déterminer le spectre des étiologies. Ainsi, les études dans les milieux communautaires, les centres de santé ou les services ambulatoires peuvent trouver différentes L’âge est une variable influente et les études qui excluent les enfants plus âgés et se concentrent sur les nourrissons sont susceptibles d’identifier plus d’infections à VRS, qui prédominent dans la petite enfance. Les nouveau-nés, en particulier, ont un ensemble distinct de pathogènes pneumoniaques. Le type de prélèvement de liquide organique prélevé et le type de tests de laboratoire effectués dépendaient dans une large mesure de la culture de sang. Bien que la majorité des études aient pratiqué des hémocultures, il est probable que les sensibilité des tests, en particulier pour Streptococcus pneumoniae, qui est un Un organisme nuisible nécessitant une collecte optimale et des conditions de laboratoire Il existe d’autres facteurs pouvant entraîner une sur-représentation des causes virales de la pneumonie. Il est à noter que l’utilisation de la PCR comme outil de diagnostic était plus élevée dans les études déjà publié dans la littérature% À mesure que les diagnostics moléculaires se généraliseront, il sera important de désagréger les tendances temporelles de l’épidémiologie de la pneumonie virale par rapport aux tendances de la pratique de laboratoire. Les résultats des tests PCR des écouvillons nasopharyngiens et oropharyngés devront être interprétés judicieusement. La présence d’acides nucléiques viraux dans le pharynx ne signifie pas nécessairement que le virus provoque une pneumonie aiguë dans les poumons Comme l’utilisation de la PCR augmente, des stratégies doivent être utilisées pour aider à interpréter ces résultats. sans pneumonie chez qui des fluides corporels similaires sont recueillis et testés, ce qui permettra une meilleure capacité Pour interpréter les résultats de la PCR Notre analyse du paysage présentait plusieurs limites. Malgré l’utilisation de stratégies de recherche multiples, nous avons probablement omis d’identifier certaines études. Nous avons seulement recherché la littérature anglaise et utilisé seulement une base de données bibliographique PubMed. excluant les études de certaines régions géographiques comme la Chine, l’Amérique Latine hispanophone, la Russie et le Moyen-Orient où il existe un nombre important de preuves dans les publications en langue locale. Nous n’avons pas recherché Embase Deuxièmement, certaines études publiées manquaient de détails suffisants pour fournir des informations sur des aspects particuliers de la conception de l’étude qui étaient intéressants. Les données manquantes notables étaient les définitions de cas, les types d’établissements et la détermination de l’éligibilité. données qui ont été fournies pour certaines études Simila Nous avons seulement contacté des chercheurs déjà identifiés sur le terrain, ce qui aurait pu entraîner des lacunes chez les personnes contactées. Troisièmement, toutes les études identifiées ne devaient pas être des études d’étiologie de la pneumonie Plusieurs avaient d’autres objectifs primaires, tels que l’étude des pneumococcies invasives. Ces études ne sont par nature pas comparables aux études qui identifient plusieurs agents pathogènes de la pneumonie en ce sens que leurs définitions de cas et la composition des patients pourraient différer. Enfin, nous n’avons pas été en mesure de vérifier les réponses à l’enquête. conclusion, la revue de la littérature et l’étude des études illustrent le contexte dans lequel l’étude PERCH sera interprétée. Les étiologies des pneumonies continueront probablement à évoluer à mesure que de plus en plus de pays introduiront des vaccins anti-Hib et antipneumococciques conjugués. la grippe va probablement devenir plus largement utilisé à travers le monde ou peut être Le développement du VRS au cours de la prochaine décennie contribuera à influencer davantage la charge de pneumonie et les étiologies restantes. L’amélioration des conditions socioéconomiques mondiales influera également sur le spectre étiologique de la pneumonie dans le futur. L’un des objectifs de PERCH est de créer une norme de référence pour la conception, la conduite et l’analyse des études d’étiologie de la pneumonie Cela fournira un cadre dans lequel des comparaisons inter-sites valides peuvent être établies et des modèles intégrés peuvent être étendus géographiquement PERCH contribuera également à raffiner la définition de cas de pneumonie et fournir des preuves pour la utilité de certains échantillons de fluides corporels et essais en laboratoire Nous espérons que la définition d’une norme et la publication des processus de validation qui ont été entrepris pour créer cette norme encourageront les chercheurs à analyser les études existantes et à concevoir de futures études en référence à cette norme. afin d’optimiser la valeur épidémiologique des résultats

Données supplémentaires

Les documents supplémentaires sont disponibles à Clinical Infectious Diseases en ligne http://www.oxfordjournalsorg/the_journals/ cid / Les documents supplémentaires sont des données fournies par les auteurs qui sont publiées pour le bénéfice du lecteur. Les documents publiés ne sont pas copiés Le contenu de toutes les données supplémentaires sont les seuls responsabilité des auteurs Les questions ou les messages concernant les erreurs doivent être adressés aux auteurs

Remarques

Avertissement

Les constatations et les conclusions sont celles des auteurs et ne représentent pas nécessairement les points de vue des centres américains de contrôle et de prévention des maladies.

Aide financière

Ce travail a été soutenu par une subvention de The Bill & amp; Fondation Melinda Gates au Centre international d’accès aux vaccins, Département de la santé internationale, École de santé publique Johns Hopkins Bloomberg

Supplément de parrainage

Cet article a été publié dans le cadre d’un supplément intitulé «Pneumonia Etiology Research for Child Health», parrainé par une subvention de The Bill & amp; Fondation Melinda Gates au projet PERCH de l’école de santé publique Johns Hopkins Bloomberg, Baltimore, Maryland

Conflits d’intérêts potentiels

Tous les auteurs: Aucun conflit rapporté Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués

Contact Us

PEDIASLEEP
125 North Main Street
Suite 500-234
Blacksburg, VA 24060

Toll-Free: 1-800-269-8262